Bicluster

ID: 552efefab744335b89d4136a
# Conditions: 196
# Genes: 14
Residual: 0.34372155345104

Bicluster Motifs

Bicluster Genes

  • Rv0053
  • Rv0054
  • Rv0055
  • Rv0056
  • Rv0466
  • Rv0871
  • Rv1914c
  • Rv2432c
  • Rv2440c
  • Rv2441c
  • Rv2784c
  • Rv2785c
  • Rv2876
  • Rv3488

Bicluster Conditions

  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.005.mM.DETA.NO.40min.rep.2.x
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.05.mM.DETA.NO.40min.rep.3.x
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.5min.rep.2
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.5min.rep.3
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.40min.rep.1.x
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.40min.rep.2.x
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.40min.rep.4.x
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.1hr.rep.1
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.1hr.rep.2
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.1hr.rep.3
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.1hr.rep.4
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.2hrs.rep.2
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.2hrs.rep.4
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.1.0.mM.DETA.NO.40min.rep.1.x
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.1.0.mM.DETA.NO.40min.rep.3.x
  • CDC1551.Ctrl.vs.0.05.mM.DETA.NO.40.min.rep.3
  • pH4.8vspH6.8..5.5h.
  • pH4.8vspH6.8..7h.
  • pH5.2vspH6.8..5.5h.
  • pH5.2vspH6.8..16h.
  • pH5.6vspH6.8..4h.
  • pH5.6vspH6.8..16h.
  • X5ug.ml.KCN.vs.DMSO.6hrs.rep.1.x
  • X5ug.ml.KCN.vs.DMSO.6hrs.rep.2.x
  • H37Rv.grown.in.7H9.vs.H37Rv.4hrs.after.infection.in.macrophages.rep.1
  • H37Rv.grown.in.7H9.vs.H37Rv.4hrs.after.infection.in.macrophages.rep.4
  • Clinical.isolate.10517.01_Afri2.extra.vs.intracellular.in.activated.macrophages.rep.1
  • Clinical.isolate.1500.03_Beijing.extra.vs.intracellular.in.activated.macrophages.rep.2
  • Clinical.isolate.2333.99_Uganda.extra.vs.intracellular.in.activated.macrophages.rep.1
  • Clinical.isolate.5468.02_Afri2.extra.vs.intracellular.in.activated.macrophages.rep.2
  • CDC1551.extra.vs.intracellular.in.activated.macrophages.rep.2
  • Mtb.response.to.pH.5.5..6.replicates.
  • Mtb.response.to.pH.6.5..6.replicates.
  • BCG.2hr.phagosomal.profile
  • BCG.24hr.phagosomal.profile
  • MTB.in.Wild.type.macrophages.for.24hrs
  • MTB.in.Wild.type.macrophages...IFNg.for.4hrs
  • MTB.in.Wild.type.macrophages...IFNg.for.24hrs
  • MTB.in.Wild.type.macrophages...IFNg.for.48hrs
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.005.mM.DETA.NO.40min.rep.1.y
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.005.mM.DETA.NO.40min.rep.2.y
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.05.mM.DETA.NO.40min.rep.2
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.05.mM.DETA.NO.40min.rep.3.y
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.40min.rep.5
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.40min.rep.6
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.0.5.mM.DETA.NO.40min.rep.7
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.1.0.mM.DETA.NO.40min.rep.1.y
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.1.0.mM.DETA.NO.40min.rep.2.y
  • MTB.strain.1254.Ctrl.vs.1.0.mM.DETA.NO.40min.rep.3.y
  • MTB.strain1254.vs.MTB.strain.1254.for.DETA.NO.exp.control.rep.1
  • MTB.strain1254.vs.MTB.strain.1254.for.DETA.NO.exp.control.rep.2
  • MTB.strain1254.vs.MTB.strain.1254.for.DETA.NO.exp.control.rep.3
  • MTB.strain1254.vs.MTB.strain.1254.for.DETA.NO.exp.control.rep.5
  • Russell_Lab_Spotted_Oligos_1.2..14.day.resting.macrophage.infection.2hr..rep.2..Russell_Lab_Spotted_Oligos_1.2..
  • Russell_Lab_Spotted_Oligos_1.3..14.day.resting.macrophage.infection.Day.2..rep.1..Russell_Lab_Spotted_Oligos_1.3..
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Tetracyclin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Tetracyclin.for.30.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.2.hr.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.2.hr.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.2.hr.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.24.hr.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.24.hr.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Tetracyclin.for.24.hr.rep.4
  • MTB1254.control.vs..0.5.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.control.vs..0.5.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.control.vs..0.5.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.control.vs..0.5.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.control.vs..0.5.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.5
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.5
  • MTB1254.control.vs..5.0.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.control.vs..5.0.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.control.vs..5.0.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.control.vs..5.0.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.control.vs..25.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.control.vs..25.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.control.vs..25.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.control.vs..25.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.control.vs..100.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.control.vs..100.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.control.vs..100.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.control.vs..100.ug.ml.Streptomycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.2.hr..ref..rep.1
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.2.hr..ref..rep.2
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.2.hr..ref..rep.3
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.2.hr..ref..rep.4
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Streptomycin.for.24.hr..ref..rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Erythromycin.for.15.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..0.5.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.2
  • MTB1254.ethanol.vs..5.0.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..25.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.4
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.1
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.3
  • MTB1254.ethanol.vs..100.ug.ml.Erythromycin.for.30.min.rep.4
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.2.hr..ref..rep.1
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.2.hr..ref..rep.2
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.2.hr..ref..rep.4
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.24.hr..ref..rep.3
  • MTB1254.control.vs..1.0.ug.ml.Erythromycin.for.24.hr..ref..rep.5
  • X0.2ug.mL..111891.DMSO..5.5h..1
  • X0.2ug.mL..111891.DMSO..5.5h..2
  • X0.2ug.mL..111891.DMSO..5.5h..3
  • X1ug.mL..111895vsDMSO..6hA
  • X2ug.mL..111895vsDMSO..6h
  • X2ug.mL..111895vsDMSO..6hA
  • X1ug.mL..124196vsDMSO..6hA
  • X5ug.mL.AmivsEtOH..6h
  • X5ug.mL.AmivsEtOH..6hA
  • X10ug.mL.Amikacin.EtOH..6h
  • X5ug.mL.CapvsEtOH..6h
  • X5ug.mL.CapvsEtOH..6hA
  • X5ug.mL.KCN.DMSO..6h..2
  • X9ug.mLAscidideminNpvsDMSO.6h
  • X10ug.mL.RoxvsEtOH..6h
  • X10ug.mL.RoxvsEtOH..6hA
  • X30ug.mL.RoxvsEtOH..6h
  • X30ug.mL.RoxvsEtOH..6hA
  • X2ug.mL.SMvsEtOH..6h
  • X2ug.mL.SMvsEtOH..6hA
  • X5ug.mLStreptomycinvsEtOH.6h
  • X5ug.mLStreptomycinvsEtOH.6hA
  • X5ug.mL.TetvsEtOH..6h
  • X10ug.mL.TetvsEtOH..6h
  • X10ug.mL.TetvsEtOH..6hA
  • H37Rv.Ctrl.vs.10.ug.ml.garlic.extract.6hrs
  • X5ug.ml.KCN.vs.DMSO.6hrs.rep.1.y
  • X5ug.ml.KCN.vs.DMSO.6hrs.rep.2.y
  • Tet_100uM_30M_01
  • Tet_20uM_30M_01
  • Tet_500ng_30M_01
  • Tet_50ng_30M_01
  • Tet_5ug_30M_01
  • X5ug.ml.Capreomycin.vs.Ethanol.6hrs.A
  • X10ug.ml.capreomycin.vs.Ethanol..6hrs